在生命科學領域,谷歌 DeepMind 再次引領潮流,推出了革命性的人工智能工具 ——AlphaGenome。這一全新的 AI 模型不僅能夠讀取多達100萬個 DNA 鹼基,還能精準預測基因突變如何影響分子功能,標誌着生物學研究的重大突破。
解密生命的藍圖
基因組是生命的藍圖,記錄了每一個細胞的 DNA 指令。雖然2003年人類基因組測序的完成使我們首次看到了 DNA 的全貌,但如何解讀這些信息,尤其是微小的 DNA 變異如何影響生物體的健康和疾病,一直是生物學領域的難題。AlphaGenome 的出現,將這一局面徹底改變。
AlphaGenome 的核心功能
AlphaGenome 具備幾個顯著的功能特點:
- ** 高效讀取與預測 **:該模型能夠處理長達100萬個鹼基字母的 DNA 序列,準確預測與基因調控相關的數千種分子特性,極大提高了研究效率。
- ** 多維度預測能力 **:AlphaGenome 不僅限於單一基因的預測,它可以同時對不同細胞類型和組織中基因的起始與終止位點、RNA 生成數量以及基因剪接位置等多方面進行預測。
- ** 變異效應評估 **:該模型能夠在短短一秒內評估基因變異對各個分子特性的影響,通過對比突變序列與原始序列的預測結果,快速量化變異的效應。
核心技術架構
AlphaGenome 的成功得益於其獨特的技術架構。模型通過卷積層初步檢測基因組序列中的短模式,並利用 Transformer 架構高效傳遞信息。訓練過程中,龐大的計算量被分散到多個互聯的張量處理單元(TPU)上,確保了快速的訓練效率。
與以往的模型相比,AlphaGenome 在長序列與高分辨率之間取得了最佳平衡,使得科學家能夠捕捉到更細微的生物學細節。
開啓生物學研究新紀元
谷歌 DeepMind 在蛋白質預測模型 AlphaFold 推出五年後,再次通過 AlphaGenome 推動了基因組學的研究。諾貝爾獎得主 Demis Hassabis 曾表示,“未來十年,AI 將會治癒所有疾病”。如今,AlphaGenome 的發佈爲這一宏偉願景奠定了基礎,未來或將推動新療法的發現與開發。
AlphaGenome 不僅是技術的創新,更是生物學研究方法的革命。通過一次 API 調用,科學家們可以迅速獲取對多種調控維度的預測,顯著提高了研究效率和準確性。這一工具的推出,預示着生物學研究的新時代即將到來。
參考資料:
https://deepmind.google/discover/blog/alphagenome-ai-for-better-understanding-the-genome/