上海人工智能実験室は復旦大学、上海交通大学医学部瑞金医院および上海市ウイルス研究院と共同で、ViraHInterという新しいAI予測モデルを開発しました。このモデルの登場により、抗ウイルス薬の開発が新たな段階に入りました。このモデルは湿式実験を必要とせずに、ウイルスが人体内のタンパク質を「乗っ取る」方法を予測できます。

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ViraHInterは、タンパク質の配列と構造の二つのモーダルを組み合わせたAIモデルです。従来のタンパク質相互作用予測方法では、通常アミノ酸配列や三次元構造のいずれかを分析していましたが、ViraHInterの画期的な点は、これらの情報を同時に正確に捉えられることです。このモデルは、ウイルスとホストタンパク質複合体の全原子三次元構造を生成し、各原子の相互関係を詳細に描写し、薬剤設計の基礎を築いています。また、タンパク質言語モデルを活用して、ウイルスの急速な変異においても保持されているコンセラベッドパターンを識別し、予測の精度を高めています。

一連のベンチマークテストにおいて、ViraHInterの性能は注目されました。ウイルスとヒトタンパク質相互作用の予測精度は0.50に達し、これはAlphaFold3より4.5倍高く、他の予測方法をはるかに上回っています。研究チームはこのモデルを使って3種類のインフルエンザ亜型を分析し、33個の共有されたホスト因子を特定することに成功し、ViraHInterが抗ウイルス薬開発における大きなポテンシャルを持っていることを示しています。